A edição 2012 da Copa Sul Americana conta com 47 equipes distribuídas da seguinte maneira: 8 brasileiras, 6 argentinas, os demais países membros da Conmebol terão 4 representantes e o último campeão da competição (Lanús - Argentina).
O torneio é dividido em seis etapas. Na primeira fase, os clubes foram distribuídos em Zona Sul (Bolívia, Chile, Paraguai e Uruguai) e Zona Norte (Colômbia, Equador, Peru e Venezuela). Os brasileiros e argentinos entram diretamente na segunda fase. O atual campeão entra diretamente na fase de oitavas de final.
Durante a Primeira fase até a semifinal, os critérios de desempate serão os seguintes:
1º) Maior saldo de gols;
2º) Maior número de gols pró assinalados no campo do adversário;
3º) Cobrança de pênaltis, de acordo com os critérios adotados pela International Board.
Em caso de empate na decisão, o campeão será a equipe com saldo de gols. Se mantiver a igualdade no tempo normal, a decisão vai para a prorrogação com dois tempos de 15 minutos. Se permanecer o empate, o campeão será definido nas penalidades.
