Na Primeira fase, os 26 times participantes são divididos em cinco grupos: quatro com 5 participantes cada e um com 6 participantes. As equipes jogam entre si em turno e returno, classificando-se para as oitavas de final os três mais bem colocados de cada grupo e o melhor quarto colocado.
Nesta fase, em caso de igualdade na pontuação, são critérios de desempate: 1) mais vitórias; 2) maior saldo de gols; 3) mais gols pró; 4) menos cartões vermelhos; 5) menos cartões amarelos; 6) sorteio. Oitavas, Quartas, Semifinal e Final são disputadas em sistema mata-mata em jogos de ida e volta.
Em caso de igualdade na pontuação, são critérios de desempate: 1) melhor saldo de gols no confronto; 2) disputa de pênaltis. Na fase mata-mata o mandante do segundo jogo será a equipe com a melhor campanha até então. Se a comparação for entre membros de grupos com quantidades de times diferentes, a melhor campanha é definida pelo aproveitamento de cada equipe.
O clube campeão será indicado a uma das vagas disponíveis para a Copa do Brasil ou poderá optar pela indicação à vaga disponível para o Campeonato Brasileiro Série D. O vice-campeão será indicado à vaga remanescente entre as duas competições.