A competição é disputada por 20 clubes, divididos em dois grupos: Grupo A e Grupo B. Em cada chave, os clubes se enfrentam duas vezes – jogos de ida e volta – totalizando 18 rodadas, com os quatro melhores de cada grupo avançando para a fase seguinte. As duas piores equipes de cada chave serão rebaixadas para a Série D de 2022.
Na fase seguinte, os oito classificados serão divididos em dois grupos de quatro clubes. Os dois mais bem classificados de cada grupo serão promovidos à Série B de 2022, enquanto o melhor clube de cada chave avança à final.
Caso haja empate de pontos entre dois ou mais clubes, os critérios de desempate serão aplicados na seguinte ordem:
Número de vitórias;
Saldo de gols;
Gols pró (marcados);
Confronto direto;
Menor número de cartões vermelhos;
Menor número de cartões amarelos;
Sorteio.